台湾图书馆的古籍与特藏文献是自1990年代后期起致力于以数位典藏方式保存重要文化资产。本馆为掌握散佚海外重要中文善本古籍文献，逐年调查海外各国中文善本古籍文献存藏及数位典藏现况，以互惠合作方式，建置「中文古籍联合目录」资料库，至2016年底止，已有超过76所国内、外机构参与本计画，总计收有逾73万笔目录。

在诸多珍藏特藏资料中，以宋、元、明、清善本为主，总计写本、刻本凡12,000余部，近13万册。近8千部之刻本中，宋版175部、金版5部、元版230部、明版6,000多部，嘉兴大藏经1部，其余为活字版，清代以及朝鲜、日本、安南流传较稀之刻本。如以册计算，善本古籍加上普通线装书古籍，约有善本旧籍中文260,760 册、西文4,296册，合计265,056册。至2016年底统计，其中宋元本珍籍约400余部。除此之外，本馆所藏6,000多部明版书，以及明清稿本和批校本古籍，更为海内外学界所推重，咸认为是研究中华古文化重要资产。

这批珍藏，除了具有史料价值外，也具有版本、艺术鉴赏的特色;无论从版式到行款、文字到图像、字体到墨色、钤印到题款、纸张到装帧，都反映出古人对版本、印刷、装帧等工艺美学的追求与坚持。在内容方面，馆藏中文善本古籍亦有以下特点:

1、网罗昔日著名藏书楼、藏书家精品，既可探知明代文化风貌，更为研究明代史籍提供许多佐证。

2、同一名家著述，往往搜集若干不同版本，足资学者校勘。

3、同一书相同版本常藏有数部，经过对照，凡书贾作伪，即易确定。

4.、明代文集和史料最为丰富，《千顷堂书目》、《四库全书总目》所未著录的，不在少数。

本馆自1990年启动文献资讯化后，有鉴于馆藏古籍的价值性与重要性，遂由特藏文献组订定计画，除持续进行文献整理与建置数位化。2002年国家型数位典藏计画(后发展为「数位典藏与数位学习国家型科技计画」)启动后，为进一步便利学者运用国图特藏资源，自2003年又陆续建置进行古籍数位化与古籍数位化国际合作计画，包括「古籍影像检索系统」、「中文古籍联合目录」、「金石拓片检索系统」、「家谱联合目录」、「标点善本题跋集录」等系统，为日后全文检索进行前置作业。

2013年国图又将前述系统整合为「古籍与特藏文献资源」资料库。透过平台提供使用者浏览及检索、本馆古籍数位典藏各项服务。至2016年底为止，系统所收诠释资料(或称后设资料metadata)计有771,650笔，另外古籍影像约6,528,494叶、金石拓片影像21,076幅。为嘉惠学界，本系统所收之影像已于2017年1月18日正式对外开放，并采台湾CREATIVE COMMONS (姓名标示─非商业性─禁止改作3.0)，祈使文化传播更为便捷，扩展台湾汉学研究资源。

在建构目录资料库之同时，本馆针对国内古籍研究资源无法取得部分全文影像之缺憾，寻求海外古籍数位化合作单位，利用台湾卓越数位化技术与经验，建立国际互惠合作模式。现阶段已完成与美国国会图书馆、华盛顿大学图书馆、加拿大多伦多大学图书馆、法国国家图书馆、柏克莱加州大学图书馆的数位化作业。

已完成的合作单位中，北美地区以美国国会图书馆为主，其收藏善本约3,500部最为大宗，包括宋元版11部、太平天国书10种、永乐大典41册及明人个人文集226种，其余尚有若干罕见的稿本，另藏中国方志2,939部，家谱400余部，以上全部近7,000种;而版本自宋迄清初，其中以明代奏议、文集具有价值。

另该馆所藏明清地方史料及清版古籍也颇有特色，同为政治、社会、经济、文学以及地方史研究的重要史料。美国华盛顿大学图书馆所藏罕见的钱谦益遗著及其他清季善本诗文集、洛克所藏之中国西南地方志、华大馆藏明版书录等。柏克莱加州大学馆藏宋元刻及嘉业堂藏书。多伦多大学图书馆馆藏宋元明清重要善本古籍。法国国家图书馆则以藏小说戏曲古籍相关资料，甚具研究价值。